Pakiet: twopaco (1.0.0+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: twopaco  ]

build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes

TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".

This package contains two programs:

 twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
          multiple complete genomes
 graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format

Inne pakiety związane z twopaco

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armhf, i386]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]

  parallelism library for C++ - runtime files

  dep: libtbb12 (>= 2021.5.0) [nie amd64]

• dep: libtbbmalloc2 (>= 2017~U7) [amd64]

  parallelism helper library for C++ - runtime files

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0) [nie amd64]

Pobieranie twopaco

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	379,3 KiB	1 616,0 KiB	[lista plików]
arm64	354,2 KiB	1 524,0 KiB	[lista plików]
armhf	349,1 KiB	1 139,0 KiB	[lista plików]
i386	414,8 KiB	1 810,0 KiB	[lista plików]
mips64el	330,2 KiB	1 969,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	370,0 KiB	1 972,0 KiB	[lista plików]
s390x	341,1 KiB	1 644,0 KiB	[lista plików]