[ ソース: twopaco ]
パッケージ: twopaco (1.0.0+dfsg-1 など)
build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes
TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".
This package contains two programs:
twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
multiple complete genomes
graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format
その他の twopaco 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armhf, i386, riscv64 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [arm64, riscv64 以外]
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
- dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
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- dep: libtbb12 (>= 2021.11.0) [riscv64]
- parallelism library for C++ - runtime files
- dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [arm64]
- dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]
- dep: libtbb12 (>= 2021.5.0) [amd64, arm64, riscv64 以外]
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- dep: libtbbmalloc2 (>= 2017~U7) [amd64]
- parallelism helper library for C++ - runtime files
- dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.11.0) [riscv64]
- dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.12.0) [arm64]
- dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0) [amd64, arm64, riscv64 以外]
twopaco のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.0.0+dfsg-1 | 379.3 kB | 1,616.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 1.0.0+dfsg-1+b1 | 352.7 kB | 1,589.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 1.0.0+dfsg-1 | 349.1 kB | 1,139.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 1.0.0+dfsg-1 | 414.8 kB | 1,810.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 1.0.0+dfsg-1 | 330.2 kB | 1,969.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 1.0.0+dfsg-1 | 370.0 kB | 1,972.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 1.0.0+dfsg-1+b1 | 375.4 kB | 1,197.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 1.0.0+dfsg-1 | 341.1 kB | 1,644.0 kB | [ファイル一覧] |