[ Paquet source : twopaco ]
Paquet : twopaco (1.0.0+dfsg-1 et autres)
Liens pour twopaco
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source twopaco :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
construction des graphes de de Bruijn à partir de plusieurs génomes complets
TwoPaCo est une implémentation de l’algorithme décrit dans la publication « TwoPaCo : An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes ».
Ce paquet fournit deux programmes :
– twopaco : outil pour la construction directe de graphes compressés pour
plusieurs génomes complets ;
– graphdump : utilitaire transformant la sortie de twopaco en format
textuel.
Autres paquets associés à twopaco
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armhf, i386, riscv64]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libstdc++6 (>= 11) [non arm64, riscv64]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
- dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
-
- dep: libtbb12 (>= 2021.11.0) [riscv64]
- bibliothèque de parallélisme pour C++ – environnement d’exécution
- dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [arm64]
- dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]
- dep: libtbb12 (>= 2021.5.0) [non amd64, arm64, riscv64]
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- dep: libtbbmalloc2 (>= 2017~U7) [amd64]
- parallelism helper library for C++ - runtime files
- dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.11.0) [riscv64]
- dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.12.0) [arm64]
- dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0) [non amd64, arm64, riscv64]
Télécharger twopaco
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.0.0+dfsg-1 | 379,3 ko | 1 616,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 1.0.0+dfsg-1+b1 | 352,7 ko | 1 589,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 1.0.0+dfsg-1 | 349,1 ko | 1 139,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 1.0.0+dfsg-1 | 414,8 ko | 1 810,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 1.0.0+dfsg-1 | 330,2 ko | 1 969,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 1.0.0+dfsg-1 | 370,0 ko | 1 972,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 1.0.0+dfsg-1+b1 | 375,4 ko | 1 197,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 1.0.0+dfsg-1 | 341,1 ko | 1 644,0 ko | [liste des fichiers] |