Pakiet: twopaco (1.0.0+dfsg-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: twopaco  ]

build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes

TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".

This package contains two programs:

 twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
          multiple complete genomes
 graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format

Inne pakiety związane z twopaco

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie alpha, armhf, hppa, i386, ia64, riscv64, sparc64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie arm64, loong64, riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [loong64, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

• dep: libtbb12 (>= 2021.11.0) [riscv64]

  parallelism library for C++ - runtime files

  dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [arm64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.5.0) [nie alpha, amd64, arm64, ia64, loong64, riscv64, sparc64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.7.0) [sparc64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.8.0) [alpha, ia64]

  dep: libtbb12 (>= 2021.9.0) [loong64]

• dep: libtbbmalloc2 (>= 2017~U7) [amd64]

  parallelism helper library for C++ - runtime files

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.11.0) [riscv64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.12.0) [arm64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0) [nie alpha, amd64, arm64, ia64, loong64, riscv64, sparc64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.7.0) [sparc64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.8.0) [alpha, ia64]

  dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.9.0) [loong64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie twopaco

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-1	370,4 KiB	1 846,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.0+dfsg-1	379,3 KiB	1 616,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.0+dfsg-1+b1	352,7 KiB	1 589,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.0+dfsg-1	349,1 KiB	1 139,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-1	392,9 KiB	1 688,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.0+dfsg-1	414,8 KiB	1 810,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-1	398,4 KiB	3 195,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-1	333,2 KiB	1 412,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.0+dfsg-1	330,2 KiB	1 969,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-1	360,6 KiB	2 103,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.0+dfsg-1	370,0 KiB	1 972,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.0+dfsg-1+b1	375,4 KiB	1 197,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.0+dfsg-1	341,1 KiB	1 644,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-1	331,2 KiB	3 261,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-1	369,3 KiB	1 466,0 KiB	[lista plików]