Package: kalign (1:3.4.0-1 and others)

[ Source: kalign  ]

Globální a progresivní nastavení seskupení

Kalign je nástroj příkazové řádky provádějící vícenásobné uspořádání biologických sekvencí. Používá algoritmus hledání řetězců Muth-Manber a tak dosahuje dobré přesnosti a rychlosti. Používá globální progresivní pojetí uspořádání obohacené užitím přibližného řetězce pro výpočet vzdálenosti sekvencí a odpovídajících místních párů na druhé straně uspořádání.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to kalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Download kalign

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1:3.4.0-1+b2	134.6 kB	1,127.0 kB	[list of files]
arm64	1:3.4.0-1+b2	86.9 kB	407.0 kB	[list of files]
armel	1:3.4.0-1+b2	79.3 kB	405.0 kB	[list of files]
armhf	1:3.4.0-1+b2	76.2 kB	277.0 kB	[list of files]
i386	1:3.4.0-1+b2	88.7 kB	341.0 kB	[list of files]
mips64el	1:3.4.0-1+b2	84.1 kB	421.0 kB	[list of files]
ppc64el	1:3.4.0-1+b2	100.0 kB	471.0 kB	[list of files]
riscv64	1:3.4.0-1+b2	88.3 kB	287.0 kB	[list of files]
s390x	1:3.4.0-1+b2	96.5 kB	371.0 kB	[list of files]