Paket: kalign (1:3.4.0-1)

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Globales und fortschreitendes multiples Sequenzalignment

Das Befehlszeilenwerkzeug Kalign gleicht mehrere biologische Sequenzen ab. Für die Erhöhung von Präzision und Geschwindigkeit nutzt es den Muth-Manber-Algorithmus, der in großen Datenmengen sich wiederholende Muster ermittelt. Das Programm verwendet einen globalen, fortschreitenden Alignment-Ansatz, ergänzt durch den Einsatz eines annähernden Musterabgleich-Algorithmus zur Berechnung von Sequenzabständen und durch die Einbeziehung lokaler Übereinstimmungen in ein ansonsten globales Alignment.

Markierungen: Biologie: Clustal/ALN, Proteine, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu kalign

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

enh: bioperl-run

BioPerl-Hüllen: Skripte
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

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Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	134,4 kB	1.126,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	83,7 kB	406,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	79,2 kB	304,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	76,9 kB	244,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	88,1 kB	340,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	82,0 kB	420,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	99,4 kB	470,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	96,2 kB	370,0 kB	[Liste der Dateien]