Package: kalign (1:3.4.0-1 and others)

[ Source: kalign  ]

Alinhamento de sequência múltipla global e progressivo

Kalign é uma ferramenta da linha de comandos para realizar alinhamentos múltiplos de sequências biológicas. Usa o algoritmo de correspondência de sequências de Muth-Manber, para melhorar tanto a precisão como a velocidade do alinhamento. Usa uma abordagem de alinhamento progressiva e global, enriquecida por usar um algoritmo para sequências de correspondências aproximadas, para calcular distâncias de sequências e por integrar correspondências locais no outro nível de alinhamento global.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to kalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Download kalign

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1:3.4.0-1+b3	134.6 kB	1,127.0 kB	[list of files]
arm64	1:3.4.0-1+b3	87.0 kB	407.0 kB	[list of files]
armel	1:3.4.0-1+b3	80.1 kB	405.0 kB	[list of files]
armhf	1:3.4.0-1+b3	77.6 kB	277.0 kB	[list of files]
i386	1:3.4.0-1+b3	88.8 kB	341.0 kB	[list of files]
mips64el	1:3.4.0-1+b3	84.1 kB	421.0 kB	[list of files]
ppc64el	1:3.4.0-1+b3	99.9 kB	471.0 kB	[list of files]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88.2 kB	287.0 kB	[list of files]
s390x	1:3.4.0-1+b3	96.4 kB	371.0 kB	[list of files]