wszystkie opcje
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: ragout  ]

Pakiet: ragout (2.3-5 i inne)

Odnośniki dla ragout

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego ragout:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Reference-Assisted Genome Ordering UTility

Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) is a tool for chromosome-level scaffolding using multiple references. Given initial assembly fragments (contigs/scaffolds) and one or multiple related references (complete or draft), it produces a chromosome-scale assembly (as a set of scaffolds).

The approach is based on the analysis of genome rearrangements (like inversions or chromosomal translocations) between the input genomes and reconstructing the most parsimonious structure of the target genome.

Ragout now supports both small and large genomes (of mammalian scale and complexity). The assembly of highly polymorphic genomes is currently limited.

Inne pakiety związane z ragout

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie ragout

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Wersja Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
alpha (port nieoficjalny) 2.3-5 2 068,7 KiB9 728,0 KiB [lista plików]
amd64 2.3-5 2 072,9 KiB9 659,0 KiB [lista plików]
arm64 2.3-5+b1 2 064,1 KiB9 664,0 KiB [lista plików]
armel 2.3-5 2 063,8 KiB9 629,0 KiB [lista plików]
armhf 2.3-5 2 066,9 KiB9 585,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 2.3-5 2 076,1 KiB9 640,0 KiB [lista plików]
i386 2.3-5 2 085,3 KiB9 673,0 KiB [lista plików]
ia64 (port nieoficjalny) 2.3-5 2 090,9 KiB9 805,0 KiB [lista plików]
m68k (port nieoficjalny) 2.3-5 2 074,2 KiB9 645,0 KiB [lista plików]
mips64el 2.3-5 2 072,5 KiB9 801,0 KiB [lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny) 2.3-5 2 078,8 KiB9 791,0 KiB [lista plików]
ppc64el 2.3-5 2 077,4 KiB9 791,0 KiB [lista plików]
riscv64 2.3-5 2 072,2 KiB9 607,0 KiB [lista plików]
s390x 2.3-5 2 075,7 KiB9 683,0 KiB [lista plików]
sh4 (port nieoficjalny) 2.3-5 2 086,8 KiB9 661,0 KiB [lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny) 2.3-5 2 064,6 KiB11 523,0 KiB [lista plików]
x32 (port nieoficjalny) 2.3-5 2 072,7 KiB9 641,0 KiB [lista plików]