Pakiet: ragout (2.3-5 i inne)
Odnośniki dla ragout
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego ragout:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Reference-Assisted Genome Ordering UTility
Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) is a tool for chromosome-level scaffolding using multiple references. Given initial assembly fragments (contigs/scaffolds) and one or multiple related references (complete or draft), it produces a chromosome-scale assembly (as a set of scaffolds).
The approach is based on the analysis of genome rearrangements (like inversions or chromosomal translocations) between the input genomes and reconstructing the most parsimonious structure of the target genome.
Ragout now supports both small and large genomes (of mammalian scale and complexity). The assembly of highly polymorphic genomes is currently limited.
Inne pakiety związane z ragout
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, ia64, sh4]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- Biblioteka wspomagająca GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64]
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
-
- dep: python3-networkx
- tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
-
- dep: python3-six
- Python 2 and 3 compatibility library
-
- rec: sibelia
- comparative genomics tool
Pobieranie ragout
Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|---|
alpha (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 068,7 KiB | 9 728,0 KiB | [lista plików] |
amd64 | 2.3-5 | 2 072,9 KiB | 9 659,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 2.3-5+b1 | 2 064,1 KiB | 9 664,0 KiB | [lista plików] |
armel | 2.3-5 | 2 063,8 KiB | 9 629,0 KiB | [lista plików] |
armhf | 2.3-5 | 2 066,9 KiB | 9 585,0 KiB | [lista plików] |
hppa (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 076,1 KiB | 9 640,0 KiB | [lista plików] |
i386 | 2.3-5 | 2 085,3 KiB | 9 673,0 KiB | [lista plików] |
ia64 (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 090,9 KiB | 9 805,0 KiB | [lista plików] |
m68k (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 074,2 KiB | 9 645,0 KiB | [lista plików] |
mips64el | 2.3-5 | 2 072,5 KiB | 9 801,0 KiB | [lista plików] |
ppc64 (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 078,8 KiB | 9 791,0 KiB | [lista plików] |
ppc64el | 2.3-5 | 2 077,4 KiB | 9 791,0 KiB | [lista plików] |
riscv64 | 2.3-5 | 2 072,2 KiB | 9 607,0 KiB | [lista plików] |
s390x | 2.3-5 | 2 075,7 KiB | 9 683,0 KiB | [lista plików] |
sh4 (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 086,8 KiB | 9 661,0 KiB | [lista plików] |
sparc64 (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 064,6 KiB | 11 523,0 KiB | [lista plików] |
x32 (port nieoficjalny) | 2.3-5 | 2 072,7 KiB | 9 641,0 KiB | [lista plików] |