Pakiet: sibelia (3.0.7+dfsg-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: sibelia  ]

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Inne pakiety związane z sibelia

• dep: lagan

  highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

  fast suffix array construction

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• sug: sibelia-examples

  comparative genomics tool (example data)

Pobieranie sibelia

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	306,8 KiB	1 318,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.0.7+dfsg-3	309,7 KiB	1 176,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.0.7+dfsg-3+b1	292,3 KiB	1 229,0 KiB	[lista plików]
armel	3.0.7+dfsg-3	283,4 KiB	1 139,0 KiB	[lista plików]
armhf	3.0.7+dfsg-3	289,5 KiB	955,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	293,4 KiB	1 075,0 KiB	[lista plików]
i386	3.0.7+dfsg-3	312,3 KiB	1 151,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	356,1 KiB	2 562,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	311,7 KiB	1 339,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.0.7+dfsg-3	278,1 KiB	1 250,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	298,9 KiB	1 292,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.0.7+dfsg-3	305,1 KiB	1 228,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.0.7+dfsg-3+b1	302,4 KiB	1 069,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.0.7+dfsg-3	275,7 KiB	1 128,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	339,7 KiB	1 092,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	269,2 KiB	1 128,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	3.0.7+dfsg-3	311,1 KiB	1 115,0 KiB	[lista plików]