Pakiet: r-cran-sctransform (0.4.1-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Inne pakiety związane z r-cran-sctransform

• dep: libblas3 [nie m68k, sh4]

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nie alpha, ia64, riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sh4]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: liblapack3 [nie m68k, sh4]

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  lub liblapack.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64, m68k, sh4]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: r-api-3.5 [m68k, sh4]

  Pakiet niedostępny

• dep: r-api-4.0 [nie m68k, sh4]

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.6.2-2) [m68k, sh4]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-dplyr [nie m68k, sh4]

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-future [nie m68k, sh4]

  R package: A Future API for R

• dep: r-cran-future.apply [nie m68k, sh4]

  apply function to elements in parallel using futures

• dep: r-cran-ggplot2 [nie m68k, sh4]

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridextra [nie m68k, sh4]

  GNU R package with extensions for the grid package

• dep: r-cran-magrittr [nie m68k, sh4]

  GNU R forward-pipe operator

• dep: r-cran-mass [nie m68k, sh4]

  Pakiet MASS dla GNU R autorstwa Venablesa i Ripleya

• dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0) [nie m68k, sh4]

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-matrixstats [nie m68k, sh4]

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0) [nie m68k, sh4]

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo [nie m68k, sh4]

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• dep: r-cran-reshape2 [nie m68k, sh4]

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-rlang [nie m68k, sh4]

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• rec: r-cran-irlba

  GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition

• rec: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Pobieranie r-cran-sctransform

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.4.1-1	482,0 KiB	827,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.4.1-1	487,7 KiB	735,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.4.1-1+b1	468,1 KiB	752,0 KiB	[lista plików]
armel	0.4.1-1	478,2 KiB	717,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.4.1-1	477,2 KiB	661,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.4.1-1	485,2 KiB	757,0 KiB	[lista plików]
i386	0.4.1-1	493,9 KiB	753,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.4.1-1	503,2 KiB	956,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.2.1-1	293,7 KiB	390,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.4.1-1	473,5 KiB	774,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.4.1-1	486,4 KiB	831,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.4.1-1	484,6 KiB	828,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.4.1-1+b1	486,0 KiB	695,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.4.1-1	488,1 KiB	751,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.2.1-1	297,4 KiB	390,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.4.1-1	470,3 KiB	1 538,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.4.1-1	487,7 KiB	718,0 KiB	[lista plików]