Paketti: r-cran-sctransform (0.4.1-1 ja muut)

[ Source: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Muut pakettiin r-cran-sctransform liittyvät paketit

• dep: libblas3 [ei m68k, sh4]

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  tai libblas.so.3

  näennäispaketti, jonka toteuttaa libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sh4]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Paketti ei saatavilla

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: liblapack3 [ei m68k, sh4]

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  tai liblapack.so.3

  näennäispaketti, jonka toteuttaa libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei arm64, m68k, sh4]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: r-api-3.5 [m68k, sh4]

  Paketti ei saatavilla

• dep: r-api-4.0 [ei m68k, sh4]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.6.2-2) [m68k, sh4]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-dplyr [ei m68k, sh4]

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-future [ei m68k, sh4]

  R package: A Future API for R

• dep: r-cran-future.apply [ei m68k, sh4]

  apply function to elements in parallel using futures

• dep: r-cran-ggplot2 [ei m68k, sh4]

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridextra [ei m68k, sh4]

  GNU R package with extensions for the grid package

• dep: r-cran-magrittr [ei m68k, sh4]

  GNU R forward-pipe operator

• dep: r-cran-mass [ei m68k, sh4]

  GNU R package of Venables and Ripley's MASS

• dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0) [ei m68k, sh4]

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-matrixstats [ei m68k, sh4]

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0) [ei m68k, sh4]

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo [ei m68k, sh4]

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• dep: r-cran-reshape2 [ei m68k, sh4]

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-rlang [ei m68k, sh4]

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• rec: r-cran-irlba

  GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition

• rec: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Imuroi r-cran-sctransform

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.4.1-1	482.0 kt	827.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.4.1-1	487.7 kt	735.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.4.1-1+b1	468.1 kt	752.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.4.1-1	478.2 kt	717.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.4.1-1	477.2 kt	661.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.4.1-1	485.2 kt	757.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.4.1-1	493.9 kt	753.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.4.1-1	503.2 kt	956.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.2.1-1	293.7 kt	390.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.4.1-1	473.5 kt	774.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.4.1-1	486.4 kt	831.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.4.1-1	484.6 kt	828.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.4.1-1+b1	486.0 kt	695.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.4.1-1	488.1 kt	751.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.2.1-1	297.4 kt	390.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.4.1-1	470.3 kt	1,538.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.4.1-1	487.7 kt	718.0 kt	[tiedostoluettelo]