Paket: r-cran-sctransform (0.4.1-1 und andere)

[ Quellcode: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-sctransform

• dep: libblas3 [nicht m68k, sh4]

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [nicht alpha, ia64, riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sh4]

  Paket nicht verfügbar

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Paket nicht verfügbar

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  Laufzeitbibliothek für GNU-Fortran-Anwendungen

• dep: liblapack3 [nicht m68k, sh4]

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht arm64, m68k, sh4]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: r-api-3.5 [m68k, sh4]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-4.0 [nicht m68k, sh4]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.6.2-2) [m68k, sh4]

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• dep: r-cran-dplyr [nicht m68k, sh4]

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-future [nicht m68k, sh4]

  R package: A Future API for R

• dep: r-cran-future.apply [nicht m68k, sh4]

  apply function to elements in parallel using futures

• dep: r-cran-ggplot2 [nicht m68k, sh4]

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• dep: r-cran-gridextra [nicht m68k, sh4]

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• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

r-cran-sctransform herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.4.1-1	482,0 kB	827,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.4.1-1	487,7 kB	735,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.4.1-1+b1	468,1 kB	752,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.4.1-1	478,2 kB	717,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.4.1-1	477,2 kB	661,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.4.1-1	485,2 kB	757,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.4.1-1	493,9 kB	753,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.4.1-1	503,2 kB	956,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.2.1-1	293,7 kB	390,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.4.1-1	473,5 kB	774,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.4.1-1	486,4 kB	831,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.4.1-1	484,6 kB	828,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.4.1-1+b1	486,0 kB	695,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.4.1-1	488,1 kB	751,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.2.1-1	297,4 kB	390,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.4.1-1	470,3 kB	1.538,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.4.1-1	487,7 kB	718,0 kB	[Liste der Dateien]