パッケージ: r-cran-sctransform (0.4.1-1 など)

[ ソース: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

その他の r-cran-sctransform 関連パッケージ

• dep: libblas3 [m68k, sh4 以外]

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, loong64, riscv64 以外]

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sh4]

  パッケージは利用できません

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

  パッケージは利用できません

• dep: libgfortran5 (>= 8) [sparc64]

  GNU Fortran アプリケーション用ランタイムライブラリ

• dep: liblapack3 [m68k, sh4 以外]

  線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版

  または liblapack.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, hppa, m68k, sh4 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, hppa]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: r-api-3.5 [m68k, sh4]

  パッケージは利用できません

• dep: r-api-4.0 [m68k, sh4 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.6.2-2) [m68k, sh4]

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-dplyr [m68k, sh4 以外]

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-future [m68k, sh4 以外]

  R package: A Future API for R

• dep: r-cran-future.apply [m68k, sh4 以外]

  apply function to elements in parallel using futures

• dep: r-cran-ggplot2 [m68k, sh4 以外]

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-gridextra [m68k, sh4 以外]

  GNU R package with extensions for the grid package

• dep: r-cran-magrittr [m68k, sh4 以外]

  GNU R forward-pipe operator

• dep: r-cran-mass [m68k, sh4 以外]

  GNU R package of Venables and Ripley's MASS

• dep: r-cran-matrix (>= 1.5-0) [m68k, sh4 以外]

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-matrixstats [m68k, sh4 以外]

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0) [m68k, sh4 以外]

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rcpparmadillo [m68k, sh4 以外]

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• dep: r-cran-reshape2 [m68k, sh4 以外]

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-rlang [m68k, sh4 以外]

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• rec: r-cran-irlba

  GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition

• rec: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

r-cran-sctransform のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.4.1-1	482.0 kB	827.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.4.1-1	487.7 kB	735.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.4.1-1+b1	468.1 kB	752.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.4.1-1	478.2 kB	717.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.4.1-1	477.2 kB	661.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.4.1-1+b1	478.4 kB	758.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.4.1-1	493.9 kB	753.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.4.1-1	503.2 kB	956.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	0.4.1-1	477.7 kB	732.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.2.1-1	293.7 kB	390.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.4.1-1	473.5 kB	774.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.4.1-1	486.4 kB	831.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.4.1-1	484.6 kB	828.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.4.1-1+b1	486.0 kB	695.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.4.1-1	488.1 kB	751.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.2.1-1	297.4 kB	390.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.4.1-1	470.3 kB	1,538.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.4.1-1	487.7 kB	718.0 kB	[ファイル一覧]