Pakiet: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6)

[ Pakiet źródłowy: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel]

  Biblioteka wsparcia zapewniająca wbudowane funkcje __atomic

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)

• dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-1t64 (>= 2.28.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0)

  Biblioteka implementująca protokół HTTP/2 (biblioteka współdzielona)

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libuv1t64 (>= 1.33.1)

  asynchronous event notification library - runtime library

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	14 877,7 KiB	66 760,0 KiB	[lista plików]
arm64	13 513,5 KiB	69 253,0 KiB	[lista plików]
armel	12 808,3 KiB	57 045,0 KiB	[lista plików]
armhf	13 061,6 KiB	46 862,0 KiB	[lista plików]
i386	16 218,0 KiB	68 306,0 KiB	[lista plików]
mips64el	11 178,0 KiB	86 557,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	14 633,2 KiB	79 173,0 KiB	[lista plików]
riscv64	14 359,3 KiB	56 112,0 KiB	[lista plików]
s390x	14 168,6 KiB	66 144,0 KiB	[lista plików]