パッケージ: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6 など)

[ ソース: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 目的: use::analysing, works-with::biological-sequence

その他の ncbi-blast+ 関連パッケージ

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]

  __atomic ビルトイン関数を提供するサポートライブラリ

• dep: libbz2-1.0

  高品質なブロックソートファイル圧縮器 - ランタイム

• dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Lightning Memory-Mapped Database shared library

• dep: libmbedcrypto16 (>= 3.6.0) [alpha, arm64, ia64 以外]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0) [alpha, arm64, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0) [alpha, arm64, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedtls21 (>= 3.6.0) [alpha, arm64, ia64 以外]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-1t64 (>= 2.28.0) [arm64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libmbedx509-7 (>= 3.6.0) [alpha, arm64, ia64 以外]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0) [alpha, ia64 以外]

  HTTP/2 プロトコルを実装するライブラリ (共有ライブラリ)

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22) [alpha, ia64 以外]

  新しい Perl 互換正規表現ライブラリ - 8 ビットランタイムファイル

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12) [alpha, ia64 以外]

  SQLite 3 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, m68k]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [alpha, ia64, m68k 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: libuv1 (>= 1.33.1) [ppc64, sparc64, x32]

  非同期イベント通知ライブラリ - ランタイムライブラリ

• dep: libuv1t64 (>= 1.33.1) [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32 以外]

  非同期イベント通知ライブラリ - ランタイムライブラリ

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

ncbi-blast+ のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.12.0+ds-4+b1	11,414.4 kB	59,755.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.16.0+ds-6+b1	14,885.0 kB	66,761.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.16.0+ds-6	13,513.5 kB	69,253.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.16.0+ds-6+b1	12,804.2 kB	57,042.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.16.0+ds-6+b1	13,063.5 kB	46,863.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.16.0+ds-6+b1	14,763.6 kB	70,272.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.16.0+ds-6+b1	16,211.9 kB	68,311.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.12.0+ds-4+b1	13,417.0 kB	85,192.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.16.0+ds-6+b1	14,155.7 kB	61,829.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.16.0+ds-6+b1	11,177.5 kB	86,558.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.16.0+ds-6+b1	14,677.8 kB	86,214.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.16.0+ds-6+b1	14,624.6 kB	79,174.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.16.0+ds-6+b1	14,360.2 kB	56,113.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.16.0+ds-6+b1	14,165.3 kB	66,145.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.16.0+ds-6+b1	25,738.4 kB	176,611.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.16.0+ds-6+b1	12,238.6 kB	149,916.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.16.0+ds-6+b1	14,955.6 kB	60,947.0 kB	[ファイル一覧]