Pakiet: ncbi-blast+ (2.11.0+ds-1)

[ Pakiet źródłowy: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)

• dep: libmbedcrypto3 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls12 (>= 2.13)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libpcre3

  Stara biblioteka wyrażeń regularnych, kompatybilna z Perl 5 - pliki wykonywalne

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	11 027,6 KiB	48 457,0 KiB	[lista plików]
arm64	9 952,6 KiB	46 144,0 KiB	[lista plików]
armel	9 277,9 KiB	39 361,0 KiB	[lista plików]
armhf	9 512,3 KiB	32 497,0 KiB	[lista plików]
i386	11 910,6 KiB	47 640,0 KiB	[lista plików]
mips64el	8 183,2 KiB	53 819,0 KiB	[lista plików]
mipsel	8 264,3 KiB	52 934,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	11 161,4 KiB	59 079,0 KiB	[lista plików]
s390x	9 900,3 KiB	48 543,0 KiB	[lista plików]