Pakiet: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-7)

[ Pakiet źródłowy: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libfastahack0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie libfastahack0

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	25,0 KiB	83,0 KiB	[lista plików]
arm64	23,1 KiB	75,0 KiB	[lista plików]
armel	23,3 KiB	69,0 KiB	[lista plików]
armhf	23,7 KiB	57,0 KiB	[lista plików]
i386	27,4 KiB	81,0 KiB	[lista plików]
mips64el	24,3 KiB	82,0 KiB	[lista plików]
mipsel	25,0 KiB	79,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	26,3 KiB	87,0 KiB	[lista plików]
s390x	22,8 KiB	77,0 KiB	[lista plików]