Pakiet: hmmer (3.4+dfsg-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: hmmer  ]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::searching, works-with-format::plaintext, Działa z: Bazy danych

Inne pakiety związane z hmmer

• dep: libc6 (>= 2.15) [hppa, m68k, sparc64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.15) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

  fast suffix array construction

• sug: hmmer-doc (>= 3.1b2-1) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

  sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

Pobieranie hmmer

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.1b2-1	1 129,7 KiB	13 177,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.4+dfsg-2	1 037,5 KiB	6 466,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.4+dfsg-2+b1	954,2 KiB	7 122,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	3.1b2-1	969,6 KiB	10 721,0 KiB	[lista plików]
i386	3.4+dfsg-2	1 068,1 KiB	6 187,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	3.1b2-1	850,4 KiB	8 566,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.4+dfsg-2	1 011,3 KiB	6 929,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	3.1b2-1	908,8 KiB	8 358,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.1b2-1	840,5 KiB	9 376,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	3.4+dfsg-2	1 049,1 KiB	6 365,0 KiB	[lista plików]