Pakiet: dialign-tx (1.0.2-12)

[ Pakiet źródłowy: dialign-t  ]

Segment-based multiple sequence alignment

DIALIGN-TX is a command line tool to perform multiple alignment of protein or DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach including several new improvements and heuristics that significantly enhance the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2 and DIALIGN-T. For pairwise alignment, DIALIGN-TX uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For multiple alignment, DIALIGN-TX uses an improved greedy procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::TODO, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-12)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie dialign-tx

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	75,1 KiB	187,0 KiB	[lista plików]
arm64	75,1 KiB	171,0 KiB	[lista plików]
armhf	60,7 KiB	123,0 KiB	[lista plików]
i386	72,4 KiB	191,0 KiB	[lista plików]