Paketti: snpomatic (1.0-5)

[ Source: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Muut pakettiin snpomatic liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi snpomatic

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	81.0 kt	209.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	73.5 kt	189.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	66.2 kt	172.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	68.4 kt	128.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	82.4 kt	212.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	75.9 kt	227.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	75.7 kt	216.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	82.4 kt	281.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	72.5 kt	205.0 kt	[tiedostoluettelo]