Package: snpomatic (1.0-5)

[ Source: snpomatic  ]

Hurtig, stringent kort-læsning oversættelsesprogram

Sekvensteknologier med høj gennemløb opretter store mængder af korte læsninger. Oversættelse af disse til en referencesekvens forbruger store mængder af behandlingstid og hukommelse, og læste oversættelsesfejl kan føre til støj eller ukorrekte sammenligninger.

SNP-o-matic er et hurtigt, stringent kort-læsning oversættelsesprogram. Det understøtter en mængde af uddatatyper og formater, for brug i filtrering, sammenligninger, sekvensbaseret genotypekald, assisteret nysamling af contigs etc.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

Download snpomatic

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	81.0 kB	209.0 kB	[list of files]
arm64	73.5 kB	189.0 kB	[list of files]
armel	66.2 kB	172.0 kB	[list of files]
armhf	68.4 kB	128.0 kB	[list of files]
i386	82.4 kB	212.0 kB	[list of files]
mips64el	75.9 kB	227.0 kB	[list of files]
mipsel	75.7 kB	216.0 kB	[list of files]
ppc64el	82.4 kB	281.0 kB	[list of files]
s390x	72.5 kB	205.0 kB	[list of files]