Pacote: snpomatic (1.0-5)

[ Fonte: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::comparing, works-with::biological-sequence

Outros pacotes relacionados a snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [não amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

Download de snpomatic

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	81.0 kB	209.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	73.5 kB	189.0 kB	[lista de arquivos]
armel	66.2 kB	172.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	68.4 kB	128.0 kB	[lista de arquivos]
i386	82.4 kB	212.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	75.9 kB	227.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	75.7 kB	216.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	82.4 kB	281.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	72.5 kB	205.0 kB	[lista de arquivos]