パッケージ: snpomatic (1.0-5)

[ ソース: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with::biological-sequence

その他の snpomatic 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

snpomatic のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	81.0 kB	209.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	73.5 kB	189.0 kB	[ファイル一覧]
armel	66.2 kB	172.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	68.4 kB	128.0 kB	[ファイル一覧]
i386	82.4 kB	212.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	75.9 kB	227.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	75.7 kB	216.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	82.4 kB	281.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	72.5 kB	205.0 kB	[ファイル一覧]