[ Source: mira ]
Package: mira-assembler (4.9.6-11 and others)
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Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
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Similar packages:
전체 게놈 샷건 및 EST 시퀀스 어셈블러
mira 게놈 조각 어셈블러는 많은 양의 유사한 반복으로 'hard'로 분류된 시퀀싱 프로젝트에 전문화된 어셈블러입니다. 명시적 시퀀스 태그 (ESTs) 전사물을 위 해, miraEST는 상이한 변이체에서 발생하는 단일 뉴클레오타이드 다형성 (SNP)을 검출하고 분류하는 동안 원래의 mRNA 전사물을 재구성하는데 특화되어 있습니다.
어셈블러는 상이한 세포 유형에서의 돌연변이 검출, 유기체 간의 전사물의 유사 성 분석, 임상 미세배열 실험에서 올리고 디자인을 위한 다양한 출처의 시퀀스 초기 어셈블리같은 다양한 작업에서 일상적으로 사용됩니다.
패키지는 다음 실행파일을 제공합니다: 제공되는 바이너리:
* mira: 게놈 시퀀스의 어셈블리를 위해 * miramem: 어셈블 프로젝트에 필요한 메모리 계산. * mirabait: 256 개의 베이스까지 kmers로 읽기를 선택하는 "grep"과 유사한 도구 * miraconvert: 시퀀스 어셈블리 파일과 관련된 모든 종류의 데이타를 변환, 추출, 때대로 재계산하는 도구.
Other Packages Related to mira-assembler
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- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)
- filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
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- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]
- Boost.Iostream 라이브러리
-
- dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]
- virtual package provided by libboost-regex1.83.0
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- dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
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- dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0)
- portable C++ multi-threading
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- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- 고성능 블럭 소팅 파일 압축 라이브러리 - 런타임
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- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, arm64, ia64, sh4, x32]
- GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, x32]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libexpat1 (>= 2.0.1)
- XML 파싱 C 라이브러리 - 런타임 라이브러리
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC 기능 지원 라이브러리
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 기능 지원 라이브러리
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 기능 지원 라이브러리
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) 지원 라이브러리
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not arm64, x32]
- GNU 표준 C++ 라이브러리 v3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- 압축 라이브러리 - 런타임
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- rec: mira-rfam-12s-rrna
- extract of RFAM 12 rRNA database
-
- sug: mira-doc
- documentation for the mira assembler
Download mira-assembler
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 4.9.6-11 | 2,591.6 kB | 8,357.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 4.9.6-11 | 2,507.6 kB | 7,996.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 4.9.6-11+b1 | 2,357.3 kB | 7,264.0 kB | [list of files] |
| armel | 4.9.6-11 | 2,145.5 kB | 7,031.0 kB | [list of files] |
| armhf | 4.9.6-11 | 2,102.0 kB | 5,119.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 4.9.6-11 | 2,454.6 kB | 7,599.0 kB | [list of files] |
| i386 | 4.9.6-11 | 2,401.7 kB | 8,227.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 4.9.6-11 | 3,535.0 kB | 14,730.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 4.9.6-11 | 2,175.7 kB | 7,707.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 4.9.6-11 | 2,301.6 kB | 8,737.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 4.9.6-11 | 2,395.3 kB | 8,224.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 4.9.6-11 | 2,535.8 kB | 8,096.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 4.9.6-11 | 2,690.3 kB | 6,472.0 kB | [list of files] |
| s390x | 4.9.6-11 | 1,967.3 kB | 7,400.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 4.9.6-11 | 2,911.8 kB | 6,749.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 4.9.6-11 | 1,985.1 kB | 7,338.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 4.9.6-11+b1 | 2,747.6 kB | 8,599.0 kB | [list of files] |