Package: mira-assembler (4.9.6-4 and others)

[ Source: mira  ]

전체 게놈 샷건 및 EST 시퀀스 어셈블러

mira 게놈 조각 어셈블러는 많은 양의 유사한 반복으로 'hard'로 분류된 시퀀싱 프로젝트에 전문화된 어셈블러입니다. 명시적 시퀀스 태그 (ESTs) 전사물을 위 해, miraEST는 상이한 변이체에서 발생하는 단일 뉴클레오타이드 다형성 (SNP)을 검출하고 분류하는 동안 원래의 mRNA 전사물을 재구성하는데 특화되어 있습니다.

어셈블러는 상이한 세포 유형에서의 돌연변이 검출, 유기체 간의 전사물의 유사 성 분석, 임상 미세배열 실험에서 올리고 디자인을 위한 다양한 출처의 시퀀스 초기 어셈블리같은 다양한 작업에서 일상적으로 사용됩니다.

패키지는 다음 실행파일을 제공합니다: 제공되는 바이너리:

 * mira: 게놈 시퀀스의 어셈블리를 위해
 * miramem: 어셈블 프로젝트에 필요한 메모리 계산.
 * mirabait: 256 개의 베이스까지 kmers로 읽기를 선택하는 "grep"과 유사한 도구
 * miraconvert: 시퀀스 어셈블리 파일과 관련된 모든 종류의 데이타를 변환,
   추출, 때대로 재계산하는 도구.

Tags: Role: Program

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• sug: mira-doc

  documentation for the mira assembler

Download mira-assembler

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	4.9.6-4+b1	2,236.4 kB	7,039.0 kB	[list of files]
arm64	4.9.6-4+b1	2,050.0 kB	6,175.0 kB	[list of files]
armhf	4.9.6-4+b1	1,830.6 kB	4,568.0 kB	[list of files]
i386	4.9.6-4+b1	2,153.1 kB	7,272.0 kB	[list of files]