Package: minimap (0.2-8 and others)

[ Source: minimap  ]

DNA 판독과 같은 긴 생체 서열의 대략적 매핑을 위한 도구

Minimap은 DNA 판독과 참조 게놈 사이, 게놈 사이, 긴 잡음 판독 사이 같은, 긴 생물학적 서열의 두 세트 사이에서 여러 대략적인 매핑 위치를 효율적으로 찾는 실험적 도구입니다. Minimap은 현재 정렬을 생성하지 않으며 이로 인해 일반적인 주류 정렬기보다 수십 배 빠릅니다. 이는 주류 정렬기를 대체하지는 않지만, 대규모 시퀀스 컬렉션 사이에서 중간정도의 차이가 있는 긴 대략적인 일치 항목을 신속하게 식별하려는 경우 유용할 수 있습니다. 이 작업의 경우 대부분의 기존 도구보다 훨씬 빠릅니다.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::calculating, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to minimap

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  압축 라이브러리 - 런타임

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.2-8	25.7 kB	83.0 kB	[list of files]
amd64	0.2-8+b3	26.3 kB	68.0 kB	[list of files]
arm64	0.2-8+b3	24.6 kB	84.0 kB	[list of files]
armel	0.2-8+b3	25.9 kB	83.0 kB	[list of files]
armhf	0.2-8+b3	24.1 kB	83.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.2-8+b2	28.2 kB	72.0 kB	[list of files]
i386	0.2-8+b3	28.6 kB	67.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.2-8	32.4 kB	98.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.2-8+b2	24.8 kB	59.0 kB	[list of files]
mips64el	0.2-8+b3	26.1 kB	86.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.2-8+b2	28.4 kB	84.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.2-8+b3	28.0 kB	84.0 kB	[list of files]
riscv64	0.2-8+b3	25.5 kB	56.0 kB	[list of files]
s390x	0.2-8+b3	27.9 kB	68.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.2-8+b2	28.8 kB	83.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.2-8+b2	22.9 kB	1,045.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.2-8+b2	25.7 kB	63.0 kB	[list of files]