Package: minimap (0.2-8 and others)

[ Source: minimap  ]

strumento per mappatura approssimata di biosequenze lunghe come letture di DNA

Minimap è uno strumento sperimentale per trovare in modo efficiente posizioni di mappatura approssimate multiple tra due insiemi di lunghe sequenze biologiche, come tra letture di DNA e genomi di riferimento, tra genomi e tra lunghe letture con rumore. Minimap attualmente non genera allineamenti e pertanto è solitamente decine di volte più veloce degli strumenti di allineamento più popolari. Non rimpiazza tali strumenti, ma può essere utile quando si desidera identificare velocemente lunghe corrispondenze approssimate con divergenze moderate in una enorme raccolta di sequenze. Per questo compito è molto più veloce della maggior parte degli strumenti esistenti.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::calculating, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to minimap

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  libreria di compressione - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.2-8	25.7 kB	83.0 kB	[list of files]
amd64	0.2-8+b3	26.3 kB	68.0 kB	[list of files]
arm64	0.2-8+b3	24.6 kB	84.0 kB	[list of files]
armel	0.2-8+b3	25.9 kB	83.0 kB	[list of files]
armhf	0.2-8+b3	24.1 kB	83.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.2-8+b2	28.2 kB	72.0 kB	[list of files]
i386	0.2-8+b3	28.6 kB	67.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.2-8	32.4 kB	98.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.2-8+b2	24.8 kB	59.0 kB	[list of files]
mips64el	0.2-8+b3	26.1 kB	86.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.2-8+b2	28.4 kB	84.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.2-8+b3	28.0 kB	84.0 kB	[list of files]
riscv64	0.2-8+b3	25.5 kB	56.0 kB	[list of files]
s390x	0.2-8+b3	27.9 kB	68.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.2-8+b2	28.8 kB	83.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.2-8+b2	22.9 kB	1,045.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.2-8+b2	25.7 kB	63.0 kB	[list of files]