Paket: minimap (0.2-8 och andra)

[ Källkod: minimap  ]

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Minimap is an experimental tool to efficiently find multiple approximate mapping positions between two sets of long biological sequences, such as between DNA reads and reference genomes, between genomes and between long noisy reads. Minimap does not generate alignments as of now and because of this, it is usually tens of times faster than mainstream aligners. It does not replace mainstream aligners, but it can be useful when you want to quickly identify long approximate matches at moderate divergence among a huge collection of sequences. For this task, it is much faster than most existing tools.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::calculating, Works with: Biological Sequence

Andra paket besläktade med minimap

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ej armel, armhf, hppa, m68k]

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k]

Hämta minimap

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.2-8	25,7 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.2-8+b2	26,3 kbyte	68,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.2-8+b1	24,3 kbyte	84,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.2-8+b2	25,8 kbyte	67,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.2-8+b2	24,0 kbyte	51,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.2-8+b1	28,2 kbyte	72,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.2-8+b2	28,5 kbyte	67,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.2-8	32,4 kbyte	98,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.2-8+b1	24,7 kbyte	59,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.2-8+b2	25,6 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.2-8+b1	28,4 kbyte	84,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.2-8+b2	28,0 kbyte	84,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.2-8+b2	25,5 kbyte	56,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.2-8+b2	27,9 kbyte	68,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.2-8	28,5 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.2-8+b1	22,9 kbyte	1.045,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.2-8+b1	25,7 kbyte	63,0 kbyte	[filförteckning]