パッケージ: probcons (1.12-13)

[ ソース: probcons  ]

確率的で整合性に基づく多重配列アライメント

タンパク質配列の多重アライメントの生成用ツールです。確率モデリングと整合性 に基づくアライメント技術を組み合わせて、PROBCONS は今までの全アライメント技 術のうちで最高の正確さを達成しました。BAliBASE ベンチマークアラインメント データベースによると、PROBCONS が生成したアライメントは現存のプログラムと比 べて統計的に顕著に改善されています。T-Coffee と比べて平均 7%、CLUSTAL W と 比べて 11%、DIALIGN に比べて 14%、より正しく配置された列を生成します。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の probcons 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [armel, armhf 以外]

• sug: probcons-extra

  probcons パッケージ由来の特別プログラム

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

probcons のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	116.1 kB	375.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	108.4 kB	326.0 kB	[ファイル一覧]
armel	104.4 kB	345.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	102.5 kB	253.0 kB	[ファイル一覧]
i386	101.3 kB	365.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	128.4 kB	408.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	125.9 kB	413.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	135.3 kB	415.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	99.6 kB	374.0 kB	[ファイル一覧]