パッケージ: boxshade (3.3.1-14 など)

[ ソース: boxshade  ]

多重配列アライメントのプリティプリンティング

Boxshade はマルチプルアライメントされたタンパク質または DNA 配列のきれいな プリントアウトを生成するプログラムです。このプログラム自身はアライメントを 行いませんので、入力ファイルとして、マルチプルアライメントプログラムが作成 したか、または個々のツールで手動編集したファイルが必要です。

Boxshade はマルチプルアライメントされた配列を PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data および ESEE-save ファイルから読み込みます (最大 150 配列 まで、各配列は最大 10000 エレメントまでの制限があります) 。各種シェーディ ングを一致する/類似の残基に適用できます。出力は画面に表示するか、または以下の フォーマットによりファイルに出力できます: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ-250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, use::typesetting, サポート形式: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, 取り扱い対象: 追加のタグが必要, テキスト

その他の boxshade 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• sug: kalign

  グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

  または clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

  または mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

  または hmmer

  タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

• sug: xfig

  Facility for Interactive Generation of figures under X11

boxshade のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	3.3.1-14	57.3 kB	185.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	3.3.1-14	54.5 kB	161.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	3.3.1-14+b1	50.4 kB	192.0 kB	[ファイル一覧]
armel	3.3.1-14	54.6 kB	163.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	3.3.1-14	52.9 kB	135.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	3.3.1-14	52.0 kB	157.0 kB	[ファイル一覧]
i386	3.3.1-14	56.0 kB	176.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	3.3.1-14	68.1 kB	277.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	3.3.1-14	50.1 kB	159.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	3.3.1-14	53.0 kB	167.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	3.3.1-14	53.3 kB	187.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	3.3.1-14	56.1 kB	193.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	3.3.1-14	56.4 kB	193.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	3.3.1-14+b2	52.7 kB	152.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	3.3.1-14	52.9 kB	168.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	3.3.1-14	60.8 kB	156.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	3.3.1-14	50.4 kB	170.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	3.3.1-14	54.4 kB	160.0 kB	[ファイル一覧]