Package: shovill (1.1.0-9 and others)

[ Source: shovill  ]

assemblaggio di genomi di isolati batterici da letture Illumina a terminali accoppiati

Shovill è una pipeline che usa SPAdes come suo nucleo centrale, ma modifica i passaggi prima e dopo il passo di assemblaggio primario, per ottenere risultati simili in un tempo minore. Shovill gestisce anche altri strumenti per assemblaggio, come SKESA, Velvet e Megahit, perciò si può sfruttare la pre- e post-elaborazione fornita da Shovill anche con essi.

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.1.0-2	12.2 kB	39.0 kB	[list of files]
amd64	1.1.0-9	13.2 kB	40.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]
riscv64 (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.1.0-7	13.1 kB	40.0 kB	[list of files]