Package: r-bioc-genomicalignments (1.14.0-1) [debports]

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rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

Questo pacchetto BioConductor fornisce contenitori efficienti per memorizzare e manipolare allineamenti genomici corti (ottenuti tipicamente allineando letture corte ad un genoma di riferimento). Ciò include contare le letture, calcolare la copertura, rilevare le giunzioni e lavorare con il contenuto in nucleotidi degli allineamenti.

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  Libreria C GNU: librerie condivise
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  Package not available

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  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

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  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

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• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.21.4)

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• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.5.3)

  contenitore per saggi BioConductor

• sug: r-bioc-bsgenome

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

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  analisi empiriche per dati digitali di espressione genica in R

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  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-rtracklayer

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  classi e metodi GNU R per grosse moli di dati di sequenziamento short-read

• sug: r-cran-runit

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
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