Package: r-bioc-rtracklayer (1.38.0-1) [debports]

[ Source:  ]

interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

Infrastruttura estensibile per interagire con più navigatori di genomi (attualmente incorporato UCSC) e manipolare tracce di annotazioni in vari formati (attualmente incorporati GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig e 2bit). L'utente può esportare e importare tracce verso e dai navigatori gestiti, così come interrogare e modificare lo stato del navigatore, come l'attuale porzione visualizzata.

Other Packages Related to r-bioc-rtracklayer

• dep: libc6 (>= 2.15)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Package not available

• dep: r-api-3.4

  Package not available

• dep: r-base-core (>= 3.4.3-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.8)

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.43.7)

  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.3.14)

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.5.4)

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.20)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.11.12)

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.8)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.9.4)

  rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor

• dep: r-cran-rcurl (>= 1.4-2)

  interfaccia client generica di rete (HTTP/FTP/...) per GNU R

• dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

  pacchetto GNU R per l'analisi e la generazione di XML

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• sug: r-bioc-genefilter

  metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-limma

  modelli lineari per dati di microarray

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

Download r-bioc-rtracklayer

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
m68k (unofficial port)	1,824.3 kB	2,765.0 kB	[list of files]