Package: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2 and others)

[ Source: amap-align  ]

allineamenti multipli di proteine con appaiamento di sequenze

AMAP è uno strumento a riga di comando per effettuare allineamenti multipli di sequenze peptidiche. Utilizza il metodo di decodifica a posteriori e allineamenti per appaiamenti di sequenze, invece del tradizionale metodo di allineamento progressivo. È l'unico programma di allineamento che permette di controllare il rapporto sensibilità/specificità. È basato sul codice sorgente di ProbCons, ma usa una precisione per le misurazioni degli allineamenti ed elimina le trasformazioni per coerenza.

Lo strumento di visualizzazione Java di AMAP 2.2 non è ancora disponibile come pacchetto Debian.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27) [not alpha, ia64, riscv64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

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  libreria di supporto a GCC

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  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf, riscv64, s390x]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	137.7 kB	1,223.0 kB	[list of files]
amd64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	129.2 kB	1,214.0 kB	[list of files]
arm64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	121.6 kB	1,182.0 kB	[list of files]
armel	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106.8 kB	1,174.0 kB	[list of files]
armhf	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	107.2 kB	1,118.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128.0 kB	1,191.0 kB	[list of files]
i386	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	112.0 kB	1,186.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	190.0 kB	1,454.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106.8 kB	1,190.0 kB	[list of files]
mips64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128.3 kB	1,216.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	130.9 kB	1,230.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	140.3 kB	1,230.0 kB	[list of files]
riscv64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134.2 kB	1,156.0 kB	[list of files]
s390x	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	109.2 kB	1,202.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131.7 kB	1,154.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	116.8 kB	1,193.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131.0 kB	1,210.0 kB	[list of files]