Balík: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2 a iné)

[ Zdroj: amap-align  ]

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Ostatné balíky súvisiace s balíkom amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27) [nie alpha, arm64, ia64, riscv64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie arm64, armel, armhf, riscv64, s390x]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

Stiahnuť amap-align

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	137.7 kB	1,223.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	129.2 kB	1,214.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134.0 kB	1,228.0 kB	[zoznam súborov]
armel	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106.8 kB	1,174.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	107.2 kB	1,118.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128.0 kB	1,191.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	112.0 kB	1,186.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	190.0 kB	1,454.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106.8 kB	1,190.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128.3 kB	1,216.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	130.9 kB	1,230.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	140.3 kB	1,230.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134.2 kB	1,156.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	109.2 kB	1,202.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131.7 kB	1,154.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	116.8 kB	1,193.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131.0 kB	1,210.0 kB	[zoznam súborov]