Pakiet: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: amap-align  ]

Wielokrotne wyrównywanie białek poprzez sekwencyjne wyżarzanie

AMAP jest narzędziem wiersza poleceń do wykonywania wielu wyrównań sekwencji peptydowych. Wykorzystuje dekodowanie typu posterior oraz wyrównywanie wyżarzonych sekwencji zamiast tradycyjnej metody stopniowego wyrównywania. Jest to jedyny program do kontrolowania czułości i specyficzności. Opiera się na kodzie źródłowym programu ProbCons, ale w odróżnieniu od niego korzysta z metody AMC (Alignment Metric Accuracy) i eliminuje przekształcanie konsystencji.

Narzędzie do wizualizacji AMAP 2.2 (napisane w języku Java) nie zostało jeszcze spakowane dla systemu Debian.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27) [nie alpha, ia64, riscv64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf, riscv64, s390x]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie amap-align

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	137,7 KiB	1 223,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	129,2 KiB	1 214,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	121,6 KiB	1 182,0 KiB	[lista plików]
armel	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106,8 KiB	1 174,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	107,2 KiB	1 118,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128,0 KiB	1 191,0 KiB	[lista plików]
i386	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	112,0 KiB	1 186,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	190,0 KiB	1 454,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106,8 KiB	1 190,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128,3 KiB	1 216,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	130,9 KiB	1 230,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	140,3 KiB	1 230,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134,2 KiB	1 156,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	109,2 KiB	1 202,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131,7 KiB	1 154,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	116,8 KiB	1 193,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131,0 KiB	1 210,0 KiB	[lista plików]