Paket: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2 und andere)

[ Quellcode: amap-align  ]

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::analysing, use::comparing, Unterstützt Formate: Reiner Text, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27) [nicht alpha, arm64, ia64, riscv64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nicht arm64, armel, armhf, riscv64, s390x]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

amap-align herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	137,7 kB	1.223,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	129,2 kB	1.214,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134,0 kB	1.228,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106,8 kB	1.174,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	107,2 kB	1.118,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128,0 kB	1.191,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	112,0 kB	1.186,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	190,0 kB	1.454,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106,8 kB	1.190,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128,3 kB	1.216,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	130,9 kB	1.230,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	140,3 kB	1.230,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134,2 kB	1.156,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	109,2 kB	1.202,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131,7 kB	1.154,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	116,8 kB	1.193,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	131,0 kB	1.210,0 kB	[Liste der Dateien]