Balík: macs (2.1.2.1-1)

[ Zdroj: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom macs

• dep: cython

  rozšírenia v jazyku C pre Python

• dep: libc6 (>= 2.15) [armhf]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.22) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386]

• dep: python

  interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy

  Numerical Python pridáva schopnosti rýchlych polí do jazyka Python

Stiahnuť macs

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2,397.2 kB	5,551.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	2,163.6 kB	5,281.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	2,307.4 kB	4,225.0 kB	[zoznam súborov]
i386	2,231.7 kB	5,714.0 kB	[zoznam súborov]