Balík: bedtools (2.27.1+dfsg-4)

[ Zdroj: bedtools  ]

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Konverzia dát, use::filtering, works-with::biological-sequence

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bedtools

• dep: libc6 (>= 2.23)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť bedtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	579.5 kB	1,955.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	515.0 kB	1,803.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	497.1 kB	1,190.0 kB	[zoznam súborov]