パッケージ: bedtools (2.27.1+dfsg-4)

[ ソース: bedtools  ]

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: スイート (統合環境), 目的: use::analysing, use::comparing, データの変換, use::filtering, works-with::biological-sequence

その他の bedtools 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.23)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

bedtools のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	579.5 kB	1,955.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	515.0 kB	1,803.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	497.1 kB	1,190.0 kB	[ファイル一覧]