Package: sibsim4 (0.20-5)

[ Source: sibsim4  ]

allinea sequenze RNA espresse su un modello DNA

Il progetto SIBsim4 si basa su sim4, che è un programma progettato per allineare una sequenza DNA espressa con una sequenza genomica, permettendo la presenza di introni. SIBsim4 è una riscrittura piuttosto estesa del codice originale con in mente i seguenti obiettivi:

 * miglioramento della velocità;
 * possibilità di usare grandi, dell'ordine di cromosomi, sequenze di
   DNA;
 * output più dettagliato sui tipi di splicing;
 * output più dettagliato sui siti polyA;
 * varie correzioni e ripuliture del codice.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	29.7 kB	73.0 kB	[list of files]
arm64	28.1 kB	73.0 kB	[list of files]
armel	27.5 kB	72.0 kB	[list of files]
armhf	26.2 kB	56.0 kB	[list of files]
i386	30.8 kB	80.0 kB	[list of files]
mips64el	29.3 kB	79.0 kB	[list of files]
mipsel	28.4 kB	78.0 kB	[list of files]
ppc64el	31.9 kB	85.0 kB	[list of files]
s390x	30.5 kB	77.0 kB	[list of files]