Пакет: sibsim4 (0.20-5)

[ Източник: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Други пакети, свързани с sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]

Изтегляне на sibsim4

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	29,7 кБ	73,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	28,1 кБ	73,0 кБ	[списък на файловете]
armel	27,5 кБ	72,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	26,2 кБ	56,0 кБ	[списък на файловете]
i386	30,8 кБ	80,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	29,3 кБ	79,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	28,4 кБ	78,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	31,9 кБ	85,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	30,5 кБ	77,0 кБ	[списък на файловете]