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Package: sibsim4 (0.20-5 and others)

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allinea sequenze RNA espresse su un modello DNA

Il progetto SIBsim4 si basa su sim4, che è un programma progettato per allineare una sequenza DNA espressa con una sequenza genomica, permettendo la presenza di introni. SIBsim4 è una riscrittura piuttosto estesa del codice originale con in mente i seguenti obiettivi:

 * miglioramento della velocità;
 * possibilità di usare grandi, dell'ordine di cromosomi, sequenze di
   DNA;
 * output più dettagliato sui tipi di splicing;
 * output più dettagliato sui siti polyA;
 * varie correzioni e ripuliture del codice.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

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Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 0.20-5 29.7 kB73.0 kB [list of files]
arm64 0.20-5+b1 28.4 kB85.0 kB [list of files]
armel 0.20-5 27.5 kB72.0 kB [list of files]
armhf 0.20-5 26.2 kB56.0 kB [list of files]
i386 0.20-5 30.8 kB80.0 kB [list of files]
mips64el 0.20-5 29.3 kB79.0 kB [list of files]
ppc64el 0.20-5 31.9 kB85.0 kB [list of files]
riscv64 0.20-5+b1 30.7 kB65.0 kB [list of files]
s390x 0.20-5 30.5 kB77.0 kB [list of files]