Pakiet: sibsim4 (0.20-5)

[ Pakiet źródłowy: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::TODO, use::comparing, Wyszukiwanie, Obsługa formatu: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]

Pobieranie sibsim4

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	29,7 KiB	73,0 KiB	[lista plików]
arm64	28,1 KiB	73,0 KiB	[lista plików]
armel	27,5 KiB	72,0 KiB	[lista plików]
armhf	26,2 KiB	56,0 KiB	[lista plików]
i386	30,8 KiB	80,0 KiB	[lista plików]
mips64el	29,3 KiB	79,0 KiB	[lista plików]
mipsel	28,4 KiB	78,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	31,9 KiB	85,0 KiB	[lista plików]
s390x	30,5 KiB	77,0 KiB	[lista plików]