Paquet : tombo (1.5.1-7 et autres)

[ Paquet source : tombo  ]

identification de nucléotides modifiés à partir de données brutes de séquençage par nanopores

Tombo est un ensemble d'outils conçu principalement pour identifier les nucléotides modifiés à partir de données de séquençage par nanopores. Tombo fournit aussi des outils pour l’analyse et la visualisation de signaux bruts de nanopores.

Autres paquets associés à tombo

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-h5py

  interface généraliste de Python pour hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

  ou python3-numpy-abi9

  Paquet indisponible

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Télécharger tombo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.5.1-7+b2	439,7 ko	1 491,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.5.1-7+b2	427,3 ko	1 482,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.5.1-7+b2	430,9 ko	1 543,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.5.1-7+b2	432,2 ko	1 415,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.5.1-7+b2	445,0 ko	1 507,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.5.1-7+b2	427,0 ko	1 555,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.5.1-7+b2	437,6 ko	1 546,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.5.1-7+b2	441,2 ko	1 406,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.5.1-7+b2	435,4 ko	1 478,0 ko	[liste des fichiers]