パッケージ: tombo (1.5.1-7)

[ ソース: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

その他の tombo 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [riscv64 以外]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

tombo のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	495.9 kB	1,831.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	472.2 kB	1,809.0 kB	[ファイル一覧]
armel	477.7 kB	1,739.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	485.1 kB	1,595.0 kB	[ファイル一覧]
i386	499.0 kB	1,867.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	472.2 kB	1,955.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	487.4 kB	2,065.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	500.3 kB	1,657.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	490.0 kB	1,809.0 kB	[ファイル一覧]