Paquet : tombo (1.5.1-7 et autres)

[ Paquet source : tombo  ]

identification de nucléotides modifiés à partir de données brutes de séquençage par nanopores

Tombo est un ensemble d'outils conçu principalement pour identifier les nucléotides modifiés à partir de données de séquençage par nanopores. Tombo fournit aussi des outils pour l’analyse et la visualisation de signaux bruts de nanopores.

Autres paquets associés à tombo

• dep: cython3 [ia64]

  extensions en C pour Python 3

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [non alpha, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.12) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [non ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.13~) [non alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

• dep: python3-h5py

  interface généraliste de Python pour hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0 [non ia64]

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

  ou python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: python3-packaging [non ia64]

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-pkg-resources [ia64]

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Télécharger tombo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.5.1-7+b1	483,3 ko	1 944,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.5.1-7+b2	439,7 ko	1 491,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.5.1-7+b2	427,3 ko	1 482,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.5.1-7+b2	430,9 ko	1 543,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.5.1-7+b2	432,2 ko	1 415,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.5.1-7+b1	495,7 ko	1 817,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.5.1-7+b2	445,0 ko	1 507,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.5.1-4	432,8 ko	1 618,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.5.1-7+b2	436,2 ko	1 546,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.5.1-7+b1	472,2 ko	1 724,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.5.1-7+b2	427,0 ko	1 555,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.5.1-7+b2	436,6 ko	1 611,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.5.1-7+b2	437,6 ko	1 546,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.5.1-7+b2	441,2 ko	1 406,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.5.1-7+b2	435,4 ko	1 478,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.5.1-7+b1	542,0 ko	1 806,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.5.1-7+b1	461,2 ko	5 280,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.5.1-7+b2	503,6 ko	1 788,0 ko	[liste des fichiers]