Pakiet: tombo (1.5.1-6)

[ Pakiet źródłowy: tombo  ]

Identyfikacja zmodyfikowanych nukleotydów z surowych danych sekwencjonowania nanoporów

Tombo to zestaw narzędzi służących przede wszystkim do identyfikacji zmodyfikowanych nukleotydów z danych sekwencjonowania nanoporów. Tombo zapewnia również narzędzia do analizy i wizualizacji surowego sygnału nanoporów.

Inne pakiety związane z tombo

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-pkg-resources

  Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources

• dep: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Pobieranie tombo

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	472,9 KiB	1 688,0 KiB	[lista plików]
arm64	450,7 KiB	1 706,0 KiB	[lista plików]
armel	457,1 KiB	1 614,0 KiB	[lista plików]
armhf	463,0 KiB	1 494,0 KiB	[lista plików]
i386	482,2 KiB	1 720,0 KiB	[lista plików]
mips64el	445,2 KiB	1 844,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	465,2 KiB	1 834,0 KiB	[lista plików]
s390x	467,1 KiB	1 686,0 KiB	[lista plików]