Paquet : tombo (1.5.1-4 et autres)

[ Paquet source : tombo  ]

identification de nucléotides modifiés à partir de données brutes de séquençage par nanopores

Tombo est un ensemble d'outils conçu principalement pour identifier les nucléotides modifiés à partir de données de séquençage par nanopores. Tombo fournit aussi des outils pour l’analyse et la visualisation de signaux bruts de nanopores.

Autres paquets associés à tombo

• dep: cython3

  extensions en⋅C pour Python⋅3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-h5py

  interface généraliste de Python pour hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-pkg-resources

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Télécharger tombo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.5.1-4+b1	418,2 ko	1 419,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.5.1-4+b1	408,3 ko	1 430,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.5.1-4+b1	411,0 ko	1 382,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.5.1-4+b1	412,1 ko	1 322,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.5.1-4+b1	423,6 ko	1 435,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.5.1-4+b1	405,6 ko	1 499,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1.5.1-4+b1	412,4 ko	1 426,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.5.1-4+b1	417,9 ko	1 494,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.5.1-4+b1	406,3 ko	1 410,0 ko	[liste des fichiers]