Paquet : tombo (1.5.1-2 et autres)

[ Paquet source : tombo  ]

identification de nucléotides modifiés à partir de données brutes de séquençage par nanopores

Tombo est un ensemble d'outils conçu principalement pour identifier les nucléotides modifiés à partir de données de séquençage par nanopores. Tombo fournit aussi des outils pour l’analyse et la visualisation de signaux bruts de nanopores.

Autres paquets associés à tombo

• dep: cython3

  extensions en⋅C pour Python⋅3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-pkg-resources

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
  un paquet virtuel est également fourni par python3-rpy2

Télécharger tombo

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.5.1-2+b2	421,8 ko	1 424,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.5.1-2+b2	410,8 ko	1 395,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.5.1-2+b2	411,9 ko	1 387,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.5.1-2+b2	412,9 ko	1 324,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.5.1-2+b2	423,4 ko	1 440,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.5.1-2+b2	408,6 ko	1 449,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1.5.1-2+b2	413,9 ko	1 408,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.5.1-2+b2	421,1 ko	1 496,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.5.1-2+b2	408,9 ko	1 419,0 ko	[liste des fichiers]